Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Knop1Q9Z2Q2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms