Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubl3Q9Z2M6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms