Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd1Q9Z2E2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms