Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VarsQ9Z1Q9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VarsQ9Z1Q9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms