Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setbp1Q9Z180 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setbp1Q9Z180 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Setbp1Q9Z180 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms