Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sumo3Q9Z172 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms