Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne6Q9Z140 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne6Q9Z140 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms