Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccl8Q9Z121 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl8Q9Z121 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms