Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itsn1Q9Z0R4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itsn1Q9Z0R4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms