Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PapolbQ9WVP6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PapolbQ9WVP6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms