Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srd5a3Q9WUP4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srd5a3Q9WUP4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms