Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrf1Q9WU00 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrf1Q9WU00 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms