Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp18Q9WTV6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp18Q9WTV6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms