Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PplQ9R269 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PplQ9R269 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PplQ9R269 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PplQ9R269 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms