Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim3Q9R1R2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim3Q9R1R2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms