Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx6Q9R1R0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms