Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms