Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf4Q9QZS2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf4Q9QZS2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf4Q9QZS2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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