Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col4a3Q9QZS0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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