Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubxn8Q9QZ49 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn8Q9QZ49 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms