Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzd4Q9QY39 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms