Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms