Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dpf1Q9QX66 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms