Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc5Q9QX29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms