Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Homer2Q9QWW1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms