Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rai2Q9QVY8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rai2Q9QVY8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms