Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk1eQ9JMK2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms