Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms