Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cabp1Q9JLK7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cabp1Q9JLK7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp1Q9JLK7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms