Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sorcs1Q9JLC4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms