Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot9Q9JKY0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms