Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nectin1Q9JKF6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms