Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Uchl3Q9JKB1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms