Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnga3Q9JJZ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnga3Q9JJZ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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