Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx20Q9JJY4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx20Q9JJY4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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