Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd3Q9JJY3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms