Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Bco1Q9JJS6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Bco1Q9JJS6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bco1Q9JJS6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Bco1Q9JJS6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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