Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfhx4Q9JJN2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms