Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ccdc86Q9JJ89 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc86Q9JJ89 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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