Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms