Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RabggtaQ9JHK4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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