Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms