Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms