Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER62

Tnfrsf22, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 22, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf22Q9ER62 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf22Q9ER62 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf22Q9ER62 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf22Q9ER62 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms