Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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