Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Ndst3Q9EQH7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Ndst3Q9EQH7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndst3Q9EQH7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Ndst3Q9EQH7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ndst3Q9EQH7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Ndst3Q9EQH7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndst3Q9EQH7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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