Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tlr1Q9EPQ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms