Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms