Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms