Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Xab2Q9DCD2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Xab2Q9DCD2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms